Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Calcoco2A2A6M5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms