Protein–RNA interactions for Protein: A1L0T3

Ssc4d, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc4dA1L0T3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ssc4dA1L0T3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms