Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
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Trbv31A0A075B5J5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv31A0A075B5J5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trbv31A0A075B5J5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trbv31A0A075B5J5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trbv31A0A075B5J5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Trbv31A0A075B5J5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Trbv31A0A075B5J5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv31A0A075B5J5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Trbv31A0A075B5J5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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