Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hdac5Q9Z2V6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hdac5Q9Z2V6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdac5Q9Z2V6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms