Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ubl3Q9Z2M6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ubl3Q9Z2M6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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