Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mbd3Q9Z2D8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mbd3Q9Z2D8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms