Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn8Q9Z260 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cldn8Q9Z260 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms