Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RfxankQ9Z205 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RfxankQ9Z205 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms