Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ap3b1Q9Z1T1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ap3b1Q9Z1T1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms