Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog1Q9Z160 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms