Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gbp2Q9Z0E6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gbp2Q9Z0E6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms