Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clcn5Q9WVD4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clcn5Q9WVD4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms