Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nme3Q9WV85 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme3Q9WV85 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme3Q9WV85 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nme3Q9WV85 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme3Q9WV85 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme3Q9WV85 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nme3Q9WV85 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms