Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUN8

Lbx2, Transcription factor LBX2, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx2Q9WUN8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lbx2Q9WUN8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lbx2Q9WUN8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms