Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lemd3Q9WU40 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lemd3Q9WU40 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lemd3Q9WU40 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms