Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PplQ9R269 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PplQ9R269 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PplQ9R269 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PplQ9R269 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PplQ9R269 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms