Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tpk1Q9R0M5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tpk1Q9R0M5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms