Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NrkQ9R0G8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NrkQ9R0G8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms