Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Wdr54Q9R0D8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Wdr54Q9R0D8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms