Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vav3Q9R0C8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vav3Q9R0C8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms