Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Npas3Q9QZQ0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Npas3Q9QZQ0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms