Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ChmlQ9QZD5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ChmlQ9QZD5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms