Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trpc3Q9QZC1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trpc3Q9QZC1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms