Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmeff2Q9QYM9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmeff2Q9QYM9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms