Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms