Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Apbb1Q9QXJ1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Apbb1Q9QXJ1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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