Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trpc5Q9QX29 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trpc5Q9QX29 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms