Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Homer2Q9QWW1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms