Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cabp2Q9JLK4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp2Q9JLK4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp2Q9JLK4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp2Q9JLK4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp2Q9JLK4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp2Q9JLK4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp2Q9JLK4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cabp2Q9JLK4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms