Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AatfQ9JKX4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AatfQ9JKX4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AatfQ9JKX4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AatfQ9JKX4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AatfQ9JKX4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AatfQ9JKX4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AatfQ9JKX4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AatfQ9JKX4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AatfQ9JKX4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AatfQ9JKX4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
AatfQ9JKX4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
AatfQ9JKX4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
AatfQ9JKX4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms