Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scamp5Q9JKD3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms