Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfhx4Q9JJN2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms