Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Riox1Q9JJF3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms