Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slc12a4Q9JIS8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms