Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ercc6l2Q9JIM3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc6l2Q9JIM3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms