Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copb1Q9JIF7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms