Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms