Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tcirg1Q9JHF5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tcirg1Q9JHF5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms