Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Usp29Q9ES63 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp29Q9ES63 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp29Q9ES63 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Usp29Q9ES63 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Usp29Q9ES63 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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