Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn4aQ9ER60 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn4aQ9ER60 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms