Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cpsf1Q9EPU4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpsf1Q9EPU4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms