Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Clstn1Q9EPL2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Clstn1Q9EPL2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms