Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnft1Q9DCN7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms