Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SrpraQ9DBG7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SrpraQ9DBG7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms