Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smg9Q9DB90 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms