Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med27Q9DB40 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med27Q9DB40 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms