Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAQ7

3110070M22Rik, RIKEN cDNA 3110070M22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110070M22RikQ9DAQ7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
3110070M22RikQ9DAQ7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms