Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc89Q9DA73 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms