Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sgf29Q9DA08 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sgf29Q9DA08 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms