Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tbc1d20Q9D9I4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tbc1d20Q9D9I4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms